首都醫(yī)科大學(xué)建校之初，學(xué)校采取分批建設(shè)，逐步充實的方針，逐批建設(shè)了基礎(chǔ)課各教研室和實驗室。1963年2月，學(xué)校制定的《北京第二醫(yī)學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)體制暫行條例》中明確提出“為了加強基礎(chǔ)各學(xué)科的領(lǐng)導(dǎo)，在學(xué)院下設(shè)基礎(chǔ)部”。至1966年基礎(chǔ)部建設(shè)完成。“文革”期間，基礎(chǔ)部建制被撤消?！拔母铩苯Y(jié)束后，根據(jù)教學(xué)需要，于1973年重新建立了醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)部，1979年更名為基礎(chǔ)部。1994年學(xué)校更名為首都醫(yī)科大學(xué)后，為適應(yīng)學(xué)科建設(shè)與發(fā)展的需求，形成資源共享、優(yōu)勢互補，將所有的學(xué)科進行了重新調(diào)整，并于1996年1月23日成立基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，揭開了我院建設(shè)的新篇章。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院是校本部規(guī)模最大、學(xué)科最全的學(xué)院之一，是集教學(xué)、科研、學(xué)生管理為一體的綜合性學(xué)院，擔(dān)負著本科生和研究生基礎(chǔ)課程培養(yǎng)的重任。學(xué)院設(shè)有神經(jīng)生物學(xué)學(xué)系、人體解剖學(xué)與組織胚胎學(xué)學(xué)系、細胞生物學(xué)學(xué)系、生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)系、生理學(xué)與病理生理學(xué)學(xué)系、病原生物學(xué)學(xué)系、免疫學(xué)學(xué)系、病理學(xué)學(xué)系、實驗動物學(xué)學(xué)系、藥理學(xué)學(xué)系和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)系等11個學(xué)（科）系，1個基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗教學(xué)中心。學(xué)院擁有生物學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)2個一級學(xué)科博士后科研流動站，6個二級學(xué)科博士授權(quán)點，2個一級學(xué)科碩士點。全院現(xiàn)有教職員工230人，其中教授38人、副教授35人；擁有博士生導(dǎo)師30人、碩士生導(dǎo)師55人。學(xué)院現(xiàn)有在讀博士、碩士研究生278人，本科生1400余人。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院承擔(dān)著基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)課程以及醫(yī)學(xué)相關(guān)生物課程的教學(xué)、教改、教材建設(shè)、課程建設(shè)、教學(xué)研究等任務(wù)。學(xué)院不斷深化教學(xué)改革，以“抓質(zhì)量、育名師”為教育教學(xué)建設(shè)的主要目標(biāo)，深入開展質(zhì)量工程建設(shè)，努力實現(xiàn)“謀教學(xué)質(zhì)量之排頭，創(chuàng)一流大學(xué)之基礎(chǔ)”的奮斗目標(biāo)。學(xué)院開設(shè)的“神經(jīng)生物學(xué)”、“生理學(xué)”2門課程被評為國家級精品課程；“醫(yī)學(xué)細胞生物學(xué)”被評為國家級雙語教學(xué)示范課程；“人體寄生蟲學(xué)”、“醫(yī)學(xué)免疫學(xué)”、“人體解剖學(xué)”、“細胞生物學(xué)”、“生物化學(xué)”、“醫(yī)學(xué)機能學(xué)實驗”6門課程獲評為北京市級精品課程；生理學(xué)教學(xué)團隊、神經(jīng)生物學(xué)教學(xué)團隊獲評國家級優(yōu)秀教學(xué)團隊，免疫學(xué)教學(xué)團隊獲評為北京市級優(yōu)秀教學(xué)團隊；基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗教學(xué)中心成為國家級實驗教學(xué)示范中心建設(shè)單位；徐群淵教授獲評為國家教學(xué)名師，安云慶、安威、諸欣平教授獲評為北京市教學(xué)名師。

學(xué)院采取“整體推進、分段建設(shè)、重點提高、突出特色”的學(xué)科建設(shè)方針，針對不同學(xué)科加以分類指導(dǎo)和分層建設(shè)，努力打造一個一級學(xué)科強大、二級學(xué)科齊全的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院。神經(jīng)生物學(xué)學(xué)科被評為國家重點學(xué)科；人體解剖與組織胚胎學(xué)、細胞生物學(xué)、病原生物學(xué)、生理學(xué)4個學(xué)科被評為北京市重點學(xué)科；病理學(xué)與病理生理學(xué)、免疫學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、動物學(xué)被評為北京市重點建設(shè)學(xué)科；“神經(jīng)變性病學(xué)實驗室”被授予教育部重點實驗室；“肝臟保護與再生調(diào)節(jié)實驗室”和“神經(jīng)再生修復(fù)研究實驗室”被評為北京市重點實驗室；細胞化學(xué)實驗室為國家中醫(yī)藥管理局科研三級實驗室。

學(xué)院倡導(dǎo)科研強院之風(fēng)，堅持學(xué)術(shù)興院之路，注重整合多學(xué)科資源，走基礎(chǔ)-臨床相結(jié)合的聯(lián)合攻關(guān)之路，發(fā)揮學(xué)校的臨床優(yōu)勢，不斷提高申報重大項目（點）的能力，推動科學(xué)研究不斷向更高層次邁進?！笆晃濉逼陂g涌現(xiàn)出以王曉民教授為代表的一批專家教授，分別承擔(dān)著國家重大、重點基金課題。目前學(xué)院有“973”計劃首席科學(xué)家1人，“973”計劃前期研究專項資助課題2項、“973”計劃資助課題8項、“863”計劃資助課題6項，獲批國家自然基金75項，北京市自然基金32項，科研經(jīng)費總計13274.8萬元。發(fā)表SCI收錄研究論文241篇，獲省部級科研成果1項，發(fā)明專利16項。

學(xué)院十分重視國內(nèi)外的交流與合作，先后與美國、英國、法國、德國、日本、奧地利、瑞典、香港等國家和地區(qū)的大學(xué)和科研機構(gòu)開展項目合作、人員交流、聯(lián)合舉辦國際會議等；與美國西北大學(xué)、英國卡迪夫大學(xué)、紐約州立大學(xué)布法羅分校、奧地利歐亞太平洋學(xué)術(shù)網(wǎng)絡(luò)、瑞典卡羅琳斯卡醫(yī)學(xué)院、香港中文大學(xué)等建立了交流合作關(guān)系。

歲月如梭，征程漫漫，展望未來，任重道遠?；A(chǔ)醫(yī)學(xué)院全體師生正以飽滿的熱情和只爭朝夕的精神為實現(xiàn)“國內(nèi)一流、國際知名”的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院而努力奮斗。

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