畜牧獸醫(yī)系創(chuàng)建于1960年，是學院的傳統(tǒng)優(yōu)勢專業(yè)。根據(jù)現(xiàn)代畜牧業(yè)發(fā)展對人才的需求，進行了以職業(yè)能力培養(yǎng)為目標的“農(nóng)業(yè)職業(yè)教育能力體系”改革，獲得農(nóng)業(yè)部教育教學改革成果一等獎，是北京農(nóng)業(yè)職業(yè)學院的主干教學系部之一。分為高職和中專兩個辦學層次，設置畜牧獸醫(yī)、動物醫(yī)學、獸醫(yī)獸藥、寵物養(yǎng)護與疫病防治、實驗動物技術(shù)專業(yè)5個專業(yè)。其中畜牧獸醫(yī)專業(yè)是國家教育部“高校高職高專專業(yè)教育教學改革”試點單位，北京市“現(xiàn)代化標志專業(yè)”、“骨干特色專業(yè)”、“國家級示范性建設專業(yè)”。

畜牧獸醫(yī)系師資力量雄厚。目前有教職員工54名，其中教授4名，推廣教授3名，副教授15名，博士后1名、博士研究生4名、碩士研究生32名。5名教師被畜牧獸醫(yī)類行業(yè)選為理事，雙師型教師35名。李玉冰主講的《動物疾病診療技術(shù)》獲國家級精品課程。張孝和主講的《養(yǎng)禽與禽病防治》課程、李志主講的《寵物疾病診治》課程獲北京市級精品課程。有11名教師擔任了教育部、農(nóng)業(yè)部21世紀國家高職高專規(guī)劃教材的主編或編者，其中李志主編的《寵物疾病診治》高職教材被評為北京市精品教材。李玉冰主編的《動物疾病診療技術(shù)》，楊久仙主編的《動物營養(yǎng)與飼料加工》獲得了2007年度全國高等農(nóng)業(yè)職業(yè)教育精品教材。楊久仙獲發(fā)明專利2項，外觀設計專利4項。近年來專業(yè)教師在國家級學術(shù)刊物上發(fā)表了專業(yè)學術(shù)論文500多篇，出版專業(yè)學術(shù)著作90多種，多數(shù)專業(yè)教師現(xiàn)在擔任著行業(yè)或企業(yè)的技術(shù)廠長或技術(shù)顧問。

畜牧獸醫(yī)系具有精良的體現(xiàn)職業(yè)教育特色的實習實訓條件。擁有畜牧獸醫(yī)類實驗室35個，液相色譜儀、氣相色譜儀、PCR檢測儀、傅立葉紅外線檢測儀、全自動定氮儀等畜牧獸醫(yī)、動物醫(yī)學和分析化驗精良設備，在滿足教育教學、實訓和科研的同時，面向社會生產(chǎn)、技術(shù)和科研服務。畜牧獸醫(yī)系擁有目前華北地區(qū)規(guī)模最大的種雞廠、動物品種多樣的綜合畜牧場、動物醫(yī)院、動物胚胎移植應用技術(shù)中心、現(xiàn)代化種禽繁育中心、動物醫(yī)院、寵物馴養(yǎng)中心和獸藥生產(chǎn)與檢測實驗室等校內(nèi)實訓基地，擁有三元綠荷、北京獸醫(yī)生物獸藥廠、北京愛牧家動物醫(yī)院等門類齊全而穩(wěn)定充足的動物醫(yī)學、養(yǎng)殖業(yè)等實訓基地，完全滿足師生實踐教學、科學研究和對農(nóng)民進行專業(yè)技術(shù)培訓需要。

畜牧獸醫(yī)系目前在校有全日制大中專學生645名，專業(yè)學生通過專業(yè)和實踐鍛煉學習，都具有扎實的專業(yè)知識和崗位技能。由于畜牧獸醫(yī)系各專業(yè)培養(yǎng)的學生綜合素質(zhì)高、實踐能力強，“下得去、留得住、用得上”，深受社會用人單位喜愛，一直保持著很高的畢業(yè)生就業(yè)率。

畜牧獸醫(yī)系以“創(chuàng)一流”為目標，積極實踐學院“開門、開放、開發(fā)”辦學宗旨，“教育為社會服務，教學為求學者服務”，團結(jié)、奮斗，開拓、進取、創(chuàng)新，積極適應北京經(jīng)濟發(fā)展需要，面向生產(chǎn)、服務、管理第一線，致力培養(yǎng)中高級技術(shù)型應用型畜牧獸醫(yī)類專門人才。

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