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水運工程系嚴(yán)格按照《STCW公約》馬尼拉修正案和《中華人民共和國船員培訓(xùn)管理規(guī)則》要求建設(shè)，取得了國家海事局頒發(fā)的船員教育和培訓(xùn)許可證書、船員教育和培訓(xùn)質(zhì)量管理體系證書；其擁有且安徽省內(nèi)唯一擁有“遠洋船員教育和培訓(xùn)”資質(zhì)。
水運工程系現(xiàn)有航海技術(shù)、輪機工程技術(shù)兩個專業(yè)，擁有航海實訓(xùn)中心、輪機實訓(xùn)中心和多個校企合作實習(xí)實訓(xùn)基地；擁有一支政治素質(zhì)過硬、業(yè)務(wù)精湛的教師隊伍，專業(yè)教師持有海船適任證書比例為100%，高級職稱教師比例為44%。
水運工程系實行半軍事化管理，嚴(yán)格按照船員教育和培訓(xùn)質(zhì)量管理體系要求培養(yǎng)社會緊缺的高技能航海人才，畢業(yè)生供不應(yīng)求、待遇優(yōu)厚，有著較高的行業(yè)知名度和社會聲譽。學(xué)生實行訂單培養(yǎng)，入學(xué)即與企業(yè)簽訂就業(yè)協(xié)議，享受企業(yè)和學(xué)院雙重獎助學(xué)金，且在校期間的培訓(xùn)費全免，開創(chuàng)全國先例。
| 專業(yè)名稱 | 專業(yè)榮譽 | 培養(yǎng)目標(biāo) | 就業(yè)方向 | 主修課程 | 職業(yè)資格 | 備注 |
| 航海技術(shù)專業(yè) | 中央財政支持提升專業(yè)服務(wù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展能力重點建設(shè)專業(yè)、安徽省特色專業(yè) | 培養(yǎng)符合《STCW公約》馬尼拉修正案和《中華人民共和國海船船員適任標(biāo)準(zhǔn)》要求，具有良好的職業(yè)道德和愛崗敬業(yè)精神，具有無限航區(qū)一類三副實際操作管理能力、能勝任現(xiàn)代化船舶駕駛與管理的高級應(yīng)用型人才。 | 畢業(yè)生主要面向全國海（航）運企業(yè)，從事遠洋、沿海船舶運輸和技術(shù)管理工作，也可在海事局、港監(jiān)局等相關(guān)的管理部門或海事類培訓(xùn)機構(gòu)從事相應(yīng)的工作。 | 航海學(xué)、船舶結(jié)構(gòu)與貨運、航海英語、船舶操縱與避碰、船舶管理等 | 熟悉與基本安全、精通急救、精通艇筏、高級消防等證書、保安意識與負(fù)有指定保安職責(zé)證書；無限航區(qū)船舶值班水手適任證書，GMDSS操作員適任證書，無限航區(qū)一類三副適任證書 | 身高1.55米以上，無色盲，僅限文史類招女生，比例不超過20% |
| 輪機工程技術(shù)專業(yè) | 培養(yǎng)符合《STCW公約》馬尼拉修正案和《中華人民共和國海船船員適任標(biāo)準(zhǔn)》要求，具有良好的職業(yè)道德和愛崗敬業(yè)精神、具有無限航區(qū)一類三管輪的實際操作技能和管理能力、能勝任現(xiàn)代化船舶機電管理技術(shù)要求的高級輪機管理應(yīng)用型人才。 | 畢業(yè)生主要面向全國海（航）運企業(yè)，從事遠洋、沿海運輸船舶的輪機技術(shù)管理工作，也可從事機電設(shè)備、工程機械相關(guān)工作或在海事局、港監(jiān)局等相關(guān)的管理部門以及海事類培訓(xùn)機構(gòu)從事相應(yīng)的工作。 | 主推進動力裝置、船舶輔機、輪機維護與修理、船舶電氣設(shè)備、船舶管理、輪機英語、輪機自動化等 | 熟悉與基本安全、精通急救、精通艇筏、高級消防等證書；保安意識與負(fù)有指定保安職責(zé)證書，無限航區(qū)船舶值班機工適任證書，無限航區(qū)一類三管輪適任證書。 | 限招男生，身高1.55米以上，無色盲 |
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